Para iniciar uma NF-e de troca em garantia, preecha a NATUREZA DE OPERAÇÃO, como abaixo:
informe a natureza "REMESSA DE TROCA EM GARANTIA".
Em seguida informe os dados do destinatário, use o icone 
e preencha todas as informações do destinátario da NFe em garantia, após inserir os dados clique no botão adicionar para adicionar os produtos.
Na tela de adicionar os produtos precher os seguintes dados (como na imagem a abaixo), CFOP:
5949 (Se a empresa de destino é da mesma UF do Emitente), 6949 (Se a empresa de destino da UF diferente do Emitente).
as demais informações como Código, Descrição do Produto, NCM, Valor Unitário e Quantidade, deve ser preenchido com as informações do produto da troca como pede o destinatário.
Após inserir os dados do produto clique na aba ICMS e mude o CST para 400 (Veja na imagem abaixo):
feito isso clique em salvar, repita o processo para os demais itens.
Ao final de inserir todos os produtos, clique em salvar, na tela inicia do emissor de NF-e para salvar a nota, confira os dados e clique em Enviar NFe para transmitir para sefaz.
Em caso de dúvida ou erros entre em contato com suporte.